Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VPREB3Q9UKI3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms