Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5Z1

DHX35, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX35Q9H5Z1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DHX35Q9H5Z1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DHX35Q9H5Z1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms