Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BHMG1C9JSJ3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms