Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC82Q8N4S0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms