Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FOXD3Q9UJU5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms