Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPRYD3Q8NCJ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms