Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms