Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
EEA1Q15075 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
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