Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.023e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-210ENST00000594847 814 ntTSL 314.74□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-224ENST00000602397 631 ntTSL 314.74□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 SLU7-204ENST00000520664 807 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.113e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-211ENST00000595357 1602 ntTSL 214.05□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-209ENST00000594704 913 ntTSL 513.78□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-203ENST00000435164 1551 ntTSL 213.45□□□□□ -0.263e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-213ENST00000596016 556 ntTSL 413.21□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-207ENST00000536011 992 ntTSL 213.06□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-212ENST00000543123 712 ntTSL 213.06□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 STRN4-217ENST00000599231 568 ntTSL 212.88□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 SLU7-202ENST00000518268 691 ntTSL 312.74□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-209ENST00000472339 2130 ntTSL 512.48□□□□□ -0.413e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 GSE1-211ENST00000496345 563 ntTSL 212.05□□□□□ -0.483e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 SLU7-203ENST00000519349 577 ntTSL 311.32□□□□□ -0.63e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.613e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 DDX41-218ENST00000625286 150 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.683e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.723e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-211ENST00000475315 2341 ntTSL 210.35□□□□□ -0.753e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-201ENST00000305586 3277 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.793e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.843e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.93e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.943e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-216ENST00000482125 739 ntTSL 58.72□□□□□ -1.013e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.053e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 C19orf53-203ENST00000588841 499 ntTSL 28.09□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 C19orf53-204ENST00000588858 666 ntTSL 37.84□□□□□ -1.153e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.233e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 DDX46-211ENST00000513987 543 ntTSL 36.87□□□□□ -1.313e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 C19orf53-201ENST00000221576 504 ntTSL 26.14□□□□□ -1.433e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 C19orf53-205ENST00000592760 357 ntTSL 35.89□□□□□ -1.473e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.73e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 VPS13D-207ENST00000476169 475 ntTSL 34.16□□□□□ -1.743e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 DDX46-204ENST00000505592 555 ntTSL 24□□□□□ -1.773e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 SLU7-206ENST00000521190 577 ntTSL 23.57□□□□□ -1.843e-6■□□□□ 8.6
TRA2AQ13595 SLU7-208ENST00000521826 568 ntTSL 43.34□□□□□ -1.873e-6■□□□□ 8.6
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TRA2AQ13595 UBAP2-207ENST00000421278 833 ntTSL 54.74□□□□□ -1.652e-10■□□□□ 8.5
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TRA2AQ13595 RBM39-222ENST00000461849 861 ntTSL 213.62□□□□□ -0.234e-14■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 RBM39-238ENST00000493853 567 ntTSL 47.48□□□□□ -1.214e-14■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.166e-13■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 BRD2-213ENST00000495733 3404 ntTSL 213.39□□□□□ -0.272e-14■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 MAT2A-205ENST00000481412 1438 ntTSL 1 (best)11.94□□□□□ -0.56e-13■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 BRD2-219ENST00000607833 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.54□□□□□ -0.562e-14■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.016e-13■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.785e-14■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.445e-14■□□□□ 8.5
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TRA2AQ13595 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 511.41□□□□□ -0.585e-14■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 RPS14-202ENST00000401695 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.645e-14■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.228e-7■□□□□ 8.5
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TRA2AQ13595 RPN2-206ENST00000456400 453 ntTSL 34.44□□□□□ -1.78e-7■□□□□ 8.5
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TRA2AQ13595 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.55e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 DNMT1-209ENST00000586799 672 ntTSL 511.78□□□□□ -0.528e-8■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UBBP4-201ENST00000583708 689 ntBASIC9.07□□□□□ -0.968e-8■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UQCRB-205ENST00000518876 3968 ntTSL 1 (best)6.2□□□□□ -1.425e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.455e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UQCRB-206ENST00000519322 750 ntTSL 26.02□□□□□ -1.455e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.585e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UQCRB-207ENST00000521036 982 ntTSL 25.16□□□□□ -1.585e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UQCRB-208ENST00000521948 997 ntTSL 24.54□□□□□ -1.685e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UQCRB-203ENST00000517603 1041 ntTSL 1 (best)3.91□□□□□ -1.785e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.935e-12■□□□□ 8.5
TRA2AQ13595 TNPO2-212ENST00000588491 737 ntTSL 516.04■□□□□ 0.169e-30■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.239e-30■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 DDX17-206ENST00000467279 712 ntTSL 523.09■■□□□ 1.299e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.139e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.139e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 315.78■□□□□ 0.128e-7■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.129e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.299e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 DDX17-201ENST00000216019 6441 ntTSL 1 (best)11.58□□□□□ -0.569e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 DDX17-205ENST00000432525 1354 ntTSL 210.41□□□□□ -0.749e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 RPL4-208ENST00000564744 671 ntTSL 28.18□□□□□ -1.13e-11■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 AFDN-210ENST00000423229 1807 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.218e-7■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 RPL4-204ENST00000563473 475 ntTSL 35.72□□□□□ -1.493e-11■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.417e-8■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.397e-8■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 CCT5-203ENST00000503026 1933 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.627e-8■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 CCT5-210ENST00000511995 1091 ntTSL 29.4□□□□□ -0.97e-8■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 CCT5-213ENST00000515390 1728 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.087e-8■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 CCT5-201ENST00000280326 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.247e-8■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 PRKAR1A-216ENST00000589017 1116 ntTSL 318.37■□□□□ 0.534e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 PRKAR1A-201ENST00000358598 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.864e-9■□□□□ 8.4
TRA2AQ13595 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 48.77□□□□□ -1.014e-9■□□□□ 8.4
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