Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC63Q05C16 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms