Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LAD1O00515 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAD1O00515 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAD1O00515 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LAD1O00515 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LAD1O00515 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LAD1O00515 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LAD1O00515 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LAD1O00515 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms