Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP25-1Q3LHN0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
KRTAP25-1Q3LHN0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms