Protein–RNA interactions for Protein: Q12308

TFC8, Transcription factor tau 60 kDa subunit, yeastyeast

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFC8Q12308 USO1YDL058W 5373 nt2.28□□□□□ -2.04
TFC8Q12308 SSK2YNR031C 4740 nt2.27□□□□□ -2.05
TFC8Q12308 CLU1YMR012W 3834 nt2.25□□□□□ -2.05
TFC8Q12308 YOR093CYOR093C 4947 nt2.25□□□□□ -2.05
TFC8Q12308 PAU24YBR301W 363 nt2.24□□□□□ -2.05
TFC8Q12308 FIG2YCR089W 4830 nt2.23□□□□□ -2.05
TFC8Q12308 NUP188YML103C 4968 nt2.21□□□□□ -2.06
TFC8Q12308 LAA1YJL207C 6045 nt2.2□□□□□ -2.06
TFC8Q12308 SEC16YPL085W 6588 nt2.2□□□□□ -2.06
TFC8Q12308 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt2.19□□□□□ -2.06
TFC8Q12308 MON2YNL297C 4911 nt2.18□□□□□ -2.06
TFC8Q12308 TRM732YMR259C 4263 nt2.15□□□□□ -2.06
TFC8Q12308 YMR045CYMR045C 5268 nt2.14□□□□□ -2.07
TFC8Q12308 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.13□□□□□ -2.07
TFC8Q12308 YGR130CYGR130C 2451 nt2.12□□□□□ -2.07
TFC8Q12308 BST1YFL025C 3090 nt2.11□□□□□ -2.07
TFC8Q12308 FKS1YLR342W 5631 nt2.11□□□□□ -2.07
TFC8Q12308 DNF3YMR162C 4971 nt2.09□□□□□ -2.07
TFC8Q12308 CDC39YCR093W 6327 nt2.08□□□□□ -2.08
TFC8Q12308 VAM6YDL077C 3150 nt2.06□□□□□ -2.08
TFC8Q12308 snR77snR77 88 nt2.06□□□□□ -2.08
TFC8Q12308 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.06□□□□□ -2.08
TFC8Q12308 SPT7YBR081C 3999 nt2.06□□□□□ -2.08
TFC8Q12308 FAB1YFR019W 6837 nt2.05□□□□□ -2.08
TFC8Q12308 TMA7YLR262C-A 195 nt2.05□□□□□ -2.08
TFC8Q12308 CFT1YDR301W 4074 nt1.98□□□□□ -2.09
TFC8Q12308 YPR117WYPR117W 7470 nt1.96□□□□□ -2.09
TFC8Q12308 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt1.96□□□□□ -2.1
TFC8Q12308 PEP1YBL017C 4740 nt1.93□□□□□ -2.1
TFC8Q12308 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.88□□□□□ -2.11
TFC8Q12308 SBH2YER019C-A 267 nt1.87□□□□□ -2.11
TFC8Q12308 BRR2YER172C 6492 nt1.87□□□□□ -2.11
TFC8Q12308 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt1.86□□□□□ -2.11
TFC8Q12308 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.83□□□□□ -2.12
TFC8Q12308 CCH1YGR217W 6120 nt1.83□□□□□ -2.12
TFC8Q12308 DOP1YDR141C 5097 nt1.78□□□□□ -2.13
TFC8Q12308 LTE1YAL024C 4308 nt1.77□□□□□ -2.13
TFC8Q12308 SOV1YMR066W 2697 nt1.76□□□□□ -2.13
TFC8Q12308 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.73□□□□□ -2.13
TFC8Q12308 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.7□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.7□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.7□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.7□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.7□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.7□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.7□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.7□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 VPS15YBR097W 4365 nt1.67□□□□□ -2.14
TFC8Q12308 MYO1YHR023W 5787 nt1.64□□□□□ -2.15
TFC8Q12308 RKR1YMR247C 4689 nt1.62□□□□□ -2.15
TFC8Q12308 MEC1YBR136W 7107 nt1.59□□□□□ -2.15
TFC8Q12308 IML1YJR138W 4755 nt1.59□□□□□ -2.15
TFC8Q12308 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt1.57□□□□□ -2.16
TFC8Q12308 YML100W-AYML100W-A 174 nt1.55□□□□□ -2.16
TFC8Q12308 YJR029WYJR029W 5268 nt1.55□□□□□ -2.16
TFC8Q12308 IRA1YBR140C 9279 nt1.54□□□□□ -2.16
TFC8Q12308 YOL014WYOL014W 375 nt1.52□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 HKR1YDR420W 5409 nt1.52□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 BUD3YCL014W 4911 nt1.51□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 SCC2YDR180W 4482 nt1.51□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.5□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.5□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 UTP20YBL004W 7482 nt1.5□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tC(GCA)QtC(GCA)Q 76 nt1.49□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.49□□□□□ -2.17
TFC8Q12308 BEM2YER155C 6504 nt1.45□□□□□ -2.18
TFC8Q12308 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.43□□□□□ -2.18
TFC8Q12308 MLP1YKR095W 5628 nt1.42□□□□□ -2.18
TFC8Q12308 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt1.34□□□□□ -2.19
TFC8Q12308 ESP1YGR098C 4893 nt1.3□□□□□ -2.2
TFC8Q12308 YJL113WYJL113W 4647 nt1.27□□□□□ -2.21
TFC8Q12308 RPL41BYDL133C-A 78 nt1.25□□□□□ -2.21
TFC8Q12308 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.23□□□□□ -2.21
TFC8Q12308 THO2YNL139C 4794 nt1.2□□□□□ -2.22
TFC8Q12308 PAU9YBL108C-A 129 nt1.19□□□□□ -2.22
TFC8Q12308 FMP27YLR454W 7887 nt1.16□□□□□ -2.22
TFC8Q12308 IQG1YPL242C 4488 nt1.13□□□□□ -2.23
TFC8Q12308 YOR335W-AYOR335W-A 81 nt1.1□□□□□ -2.23
TFC8Q12308 snR58snR58 96 nt1.08□□□□□ -2.24
TFC8Q12308 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TFC8Q12308 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TFC8Q12308 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TFC8Q12308 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TFC8Q12308 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.07□□□□□ -2.24
TFC8Q12308 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt1.02□□□□□ -2.25
TFC8Q12308 snR6snR6 112 nt1□□□□□ -2.25
TFC8Q12308 snR128snR128 126 nt0.9□□□□□ -2.27
TFC8Q12308 snR161snR161 161 nt0.88□□□□□ -2.27
TFC8Q12308 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.87□□□□□ -2.27
TFC8Q12308 UTP10YJL109C 5310 nt0.85□□□□□ -2.27
TFC8Q12308 snR73snR73 106 nt0.78□□□□□ -2.28
TFC8Q12308 tA(UGC)QtA(UGC)Q 76 nt0.76□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TFC8Q12308 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.75□□□□□ -2.29
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