Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KLF12Q9Y4X4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLF12Q9Y4X4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLF12Q9Y4X4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLF12Q9Y4X4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms