Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q3

TMED3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED3Q9Y3Q3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMED3Q9Y3Q3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMED3Q9Y3Q3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMED3Q9Y3Q3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMED3Q9Y3Q3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMED3Q9Y3Q3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms