Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VNN3Q9NY84 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VNN3Q9NY84 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
VNN3Q9NY84 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VNN3Q9NY84 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms