Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVK6

TMED9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED9Q9BVK6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMED9Q9BVK6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMED9Q9BVK6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMED9Q9BVK6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMED9Q9BVK6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMED9Q9BVK6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms