Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GFI1Q99684 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFI1Q99684 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFI1Q99684 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFI1Q99684 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms