Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPZA3Q96KX2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPZA3Q96KX2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPZA3Q96KX2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPZA3Q96KX2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPZA3Q96KX2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPZA3Q96KX2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms