Protein–RNA interactions for Protein: Q96KQ4

PPP1R13B, Apoptosis-stimulating of p53 protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R13BQ96KQ4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PPP1R13BQ96KQ4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPP1R13BQ96KQ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PPP1R13BQ96KQ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPP1R13BQ96KQ4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R13BQ96KQ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPP1R13BQ96KQ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPP1R13BQ96KQ4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPP1R13BQ96KQ4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PPP1R13BQ96KQ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPP1R13BQ96KQ4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPP1R13BQ96KQ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPP1R13BQ96KQ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R13BQ96KQ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R13BQ96KQ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PPP1R13BQ96KQ4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPP1R13BQ96KQ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms