Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00526Q96FQ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00526Q96FQ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00526Q96FQ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms