Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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