Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C15orf40Q8WUR7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
C15orf40Q8WUR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C15orf40Q8WUR7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C15orf40Q8WUR7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C15orf40Q8WUR7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms