Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MCTP1Q6DN14 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
MCTP1Q6DN14 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MCTP1Q6DN14 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MCTP1Q6DN14 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
MCTP1Q6DN14 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
MCTP1Q6DN14 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms