Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
REP15Q6BDI9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
REP15Q6BDI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
REP15Q6BDI9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
REP15Q6BDI9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
REP15Q6BDI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms