Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAX1Q5SQQ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VAX1Q5SQQ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VAX1Q5SQQ9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VAX1Q5SQQ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VAX1Q5SQQ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms