Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB11BQ15907 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11BQ15907 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11BQ15907 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11BQ15907 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11BQ15907 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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