Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB40BQ12829 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB40BQ12829 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB40BQ12829 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB40BQ12829 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB40BQ12829 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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