Protein–RNA interactions for Protein: Q12697

YPK9, Vacuolar cation-transporting ATPase YPK9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPK9Q12697 KEL3YPL263C 1956 nt13.36□□□□□ -0.27
YPK9Q12697 ADE1YAR015W 921 nt13.36□□□□□ -0.27
YPK9Q12697 ITR2YOL103W 1830 nt13.36□□□□□ -0.27
YPK9Q12697 YOR325WYOR325W 474 nt13.35□□□□□ -0.27
YPK9Q12697 MFT1YML062C 1179 nt13.34□□□□□ -0.27
YPK9Q12697 YAT1YAR035W 2064 nt13.34□□□□□ -0.27
YPK9Q12697 PBP1YGR178C 2169 nt13.34□□□□□ -0.27
YPK9Q12697 PET494YNR045W 1470 nt13.32□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 SUV3YPL029W 2214 nt13.3□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 TAD2YJL035C 753 nt13.29□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 CRC1YOR100C 984 nt13.29□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 RPS6AYPL090C 711 nt13.29□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 RPS6BYBR181C 711 nt13.29□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 NAR1YNL240C 1476 nt13.28□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 YJL043WYJL043W 774 nt13.28□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 HAP5YOR358W 729 nt13.28□□□□□ -0.28
YPK9Q12697 OPI10YOL032W 741 nt13.26□□□□□ -0.29
YPK9Q12697 CYT2YKL087C 675 nt13.25□□□□□ -0.29
YPK9Q12697 FUS3YBL016W 1062 nt13.24□□□□□ -0.29
YPK9Q12697 ALG12YNR030W 1656 nt13.23□□□□□ -0.29
YPK9Q12697 YMR265CYMR265C 1386 nt13.22□□□□□ -0.29
YPK9Q12697 LSR1LSR1 1175 nt13.22□□□□□ -0.29
YPK9Q12697 DLD3YEL071W 1491 nt13.21□□□□□ -0.29
YPK9Q12697 YFR020WYFR020W 699 nt13.21□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 COS10YNR075W 1125 nt13.21□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 SAN1YDR143C 1833 nt13.21□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 YPT11YNL304W 1254 nt13.2□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 snR31snR31 225 nt13.2□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 PTC6YCR079W 1329 nt13.18□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 RSM7YJR113C 744 nt13.17□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 BXI1YNL305C 894 nt13.17□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 TDH1YJL052W 999 nt13.16□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 INA1YLR413W 2028 nt13.15□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 YER156CYER156C 1017 nt13.15□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 CAK1YFL029C 1107 nt13.15□□□□□ -0.3
YPK9Q12697 VMA11YPL234C 495 nt13.13□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 YPR084WYPR084W 1371 nt13.13□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 ILV3YJR016C 1758 nt13.13□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 NUP53YMR153W 1428 nt13.12□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 YLR358CYLR358C 564 nt13.12□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 RPC82YPR190C 1965 nt13.11□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 KGD2YDR148C 1392 nt13.11□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 YIL168WYIL168W 384 nt13.11□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 OCH1YGL038C 1443 nt13.09□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 RDN25-1RDN25-1 3396 nt13.09□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 RDN25-2RDN25-2 3396 nt13.09□□□□□ -0.31
YPK9Q12697 GID8YMR135C 1368 nt13.08□□□□□ -0.32
YPK9Q12697 GAS1YMR307W 1680 nt13.08□□□□□ -0.32
YPK9Q12697 RPN14YGL004C 1254 nt13.06□□□□□ -0.32
YPK9Q12697 RRT6YGL146C 936 nt13.03□□□□□ -0.32
YPK9Q12697 RRT14YIL127C 621 nt13.03□□□□□ -0.32
YPK9Q12697 MRS6YOR370C 1812 nt13.02□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 NCA3YJL116C 1014 nt13.02□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 YHR219WYHR219W 1875 nt13.01□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 YLR460CYLR460C 1131 nt13.01□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 MCH5YOR306C 1566 nt13.01□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 RPR1RPR1 369 nt13□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 SNX3YOR357C 489 nt13□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 YBL095WYBL095W 813 nt12.99□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 HAC1YFL031W 717 nt12.98□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 CHS7YHR142W 951 nt12.98□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 SBP1YHL034C 885 nt12.97□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 MET22YOL064C 1074 nt12.97□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 YKL133CYKL133C 1392 nt12.96□□□□□ -0.33
YPK9Q12697 ARO8YGL202W 1503 nt12.94□□□□□ -0.34
YPK9Q12697 KES1YPL145C 1305 nt12.91□□□□□ -0.34
YPK9Q12697 YML079WYML079W 606 nt12.91□□□□□ -0.34
YPK9Q12697 UME6YDR207C 2511 nt12.9□□□□□ -0.34
YPK9Q12697 RHO1YPR165W 630 nt12.87□□□□□ -0.35
YPK9Q12697 YDR476CYDR476C 675 nt12.86□□□□□ -0.35
YPK9Q12697 YPT31YER031C 672 nt12.86□□□□□ -0.35
YPK9Q12697 SHC1YER096W 1539 nt12.85□□□□□ -0.35
YPK9Q12697 MUP1YGR055W 1725 nt12.85□□□□□ -0.35
YPK9Q12697 PDC6YGR087C 1692 nt12.83□□□□□ -0.36
YPK9Q12697 SRY1YKL218C 981 nt12.83□□□□□ -0.36
YPK9Q12697 PUP2YGR253C 783 nt12.82□□□□□ -0.36
YPK9Q12697 OLA1YBR025C 1185 nt12.82□□□□□ -0.36
YPK9Q12697 URA1YKL216W 945 nt12.81□□□□□ -0.36
YPK9Q12697 RNA170RNA170 169 nt12.79□□□□□ -0.36
YPK9Q12697 COQ8YGL119W 1506 nt12.78□□□□□ -0.36
YPK9Q12697 THI73YLR004C 1572 nt12.78□□□□□ -0.36
YPK9Q12697 RPD3YNL330C 1302 nt12.77□□□□□ -0.37
YPK9Q12697 ATP2YJR121W 1536 nt12.76□□□□□ -0.37
YPK9Q12697 APT1YML022W 564 nt12.73□□□□□ -0.37
YPK9Q12697 SPG1YGR236C 288 nt12.71□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt12.71□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 CYS3YAL012W 1185 nt12.69□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 SGA1YIL099W 1650 nt12.69□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 PSP2YML017W 1782 nt12.69□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 THI3YDL080C 1830 nt12.68□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt12.66□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 PNS1YOR161C 1620 nt12.66□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 GGA2YHR108W 1758 nt12.66□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 UME1YPL139C 1383 nt12.66□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 SPR1YOR190W 1338 nt12.65□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt12.65□□□□□ -0.38
YPK9Q12697 SPT20YOL148C 1815 nt12.65□□□□□ -0.39
YPK9Q12697 SLM3YDL033C 1254 nt12.64□□□□□ -0.39
YPK9Q12697 PUP3YER094C 618 nt12.64□□□□□ -0.39
YPK9Q12697 RPC31YNL151C 756 nt12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.1 ms