Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 CCT2YIL142W 1584 nt12.95□□□□□ -0.34
TY2B-BQ12491 YJL043WYJL043W 774 nt12.94□□□□□ -0.34
TY2B-BQ12491 ITR2YOL103W 1830 nt12.93□□□□□ -0.34
TY2B-BQ12491 PET494YNR045W 1470 nt12.91□□□□□ -0.34
TY2B-BQ12491 PBP1YGR178C 2169 nt12.9□□□□□ -0.34
TY2B-BQ12491 YOR325WYOR325W 474 nt12.89□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 NUP53YMR153W 1428 nt12.87□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 TAD2YJL035C 753 nt12.86□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 YLR358CYLR358C 564 nt12.86□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 COS10YNR075W 1125 nt12.86□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 MFT1YML062C 1179 nt12.84□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 YER156CYER156C 1017 nt12.84□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 ENT4YLL038C 744 nt12.84□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 RPS6AYPL090C 711 nt12.84□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 RPS6BYBR181C 711 nt12.84□□□□□ -0.35
TY2B-BQ12491 LSR1LSR1 1175 nt12.83□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 CRC1YOR100C 984 nt12.83□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 KEL3YPL263C 1956 nt12.83□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 SBP1YHL034C 885 nt12.82□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 BXI1YNL305C 894 nt12.82□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 VMA11YPL234C 495 nt12.82□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt12.81□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 TDH1YJL052W 999 nt12.81□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 NCA3YJL116C 1014 nt12.8□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 HAP5YOR358W 729 nt12.8□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 DLD3YEL071W 1491 nt12.79□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 SAN1YDR143C 1833 nt12.79□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 NAR1YNL240C 1476 nt12.77□□□□□ -0.36
TY2B-BQ12491 PTC6YCR079W 1329 nt12.76□□□□□ -0.37
TY2B-BQ12491 YMR265CYMR265C 1386 nt12.76□□□□□ -0.37
TY2B-BQ12491 HAC1YFL031W 717 nt12.75□□□□□ -0.37
TY2B-BQ12491 YPT11YNL304W 1254 nt12.75□□□□□ -0.37
TY2B-BQ12491 YIL168WYIL168W 384 nt12.74□□□□□ -0.37
TY2B-BQ12491 RIM2YBR192W 1134 nt12.74□□□□□ -0.37
TY2B-BQ12491 ILV3YJR016C 1758 nt12.72□□□□□ -0.37
TY2B-BQ12491 RRT6YGL146C 936 nt12.69□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 snR31snR31 225 nt12.67□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 YPR084WYPR084W 1371 nt12.67□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 SRY1YKL218C 981 nt12.66□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 MET22YOL064C 1074 nt12.66□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 OCH1YGL038C 1443 nt12.66□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 CAK1YFL029C 1107 nt12.66□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 KGD2YDR148C 1392 nt12.66□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 YFR020WYFR020W 699 nt12.65□□□□□ -0.38
TY2B-BQ12491 CYT2YKL087C 675 nt12.64□□□□□ -0.39
TY2B-BQ12491 RPR1RPR1 369 nt12.64□□□□□ -0.39
TY2B-BQ12491 RPC82YPR190C 1965 nt12.6□□□□□ -0.39
TY2B-BQ12491 RDN25-1RDN25-1 3396 nt12.6□□□□□ -0.39
TY2B-BQ12491 RDN25-2RDN25-2 3396 nt12.6□□□□□ -0.39
TY2B-BQ12491 YML079WYML079W 606 nt12.6□□□□□ -0.39
TY2B-BQ12491 GAS1YMR307W 1680 nt12.59□□□□□ -0.39
TY2B-BQ12491 MRS6YOR370C 1812 nt12.59□□□□□ -0.39
TY2B-BQ12491 YHR219WYHR219W 1875 nt12.58□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 GID8YMR135C 1368 nt12.58□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 ALG12YNR030W 1656 nt12.58□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 SHC1YER096W 1539 nt12.58□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 RRT14YIL127C 621 nt12.57□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 RSM7YJR113C 744 nt12.57□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 CHS7YHR142W 951 nt12.56□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 SNX3YOR357C 489 nt12.56□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 YBL095WYBL095W 813 nt12.55□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 SPG1YGR236C 288 nt12.54□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 RPN14YGL004C 1254 nt12.53□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 URA1YKL216W 945 nt12.53□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 YKL133CYKL133C 1392 nt12.52□□□□□ -0.4
TY2B-BQ12491 PUP2YGR253C 783 nt12.51□□□□□ -0.41
TY2B-BQ12491 INA1YLR413W 2028 nt12.49□□□□□ -0.41
TY2B-BQ12491 APT1YML022W 564 nt12.48□□□□□ -0.41
TY2B-BQ12491 CYS3YAL012W 1185 nt12.46□□□□□ -0.41
TY2B-BQ12491 YLR460CYLR460C 1131 nt12.46□□□□□ -0.41
TY2B-BQ12491 ARO8YGL202W 1503 nt12.45□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 NVJ2YPR091C 2313 nt12.44□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 PIH1YHR034C 1035 nt12.44□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 YJL144WYJL144W 315 nt12.43□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 YDR476CYDR476C 675 nt12.42□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 RHO1YPR165W 630 nt12.42□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 PDC6YGR087C 1692 nt12.41□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 YPT31YER031C 672 nt12.4□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 RNA170RNA170 169 nt12.4□□□□□ -0.42
TY2B-BQ12491 KES1YPL145C 1305 nt12.39□□□□□ -0.43
TY2B-BQ12491 SPR1YOR190W 1338 nt12.38□□□□□ -0.43
TY2B-BQ12491 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt12.38□□□□□ -0.43
TY2B-BQ12491 UME1YPL139C 1383 nt12.36□□□□□ -0.43
TY2B-BQ12491 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt12.35□□□□□ -0.43
TY2B-BQ12491 YOR111WYOR111W 699 nt12.35□□□□□ -0.43
TY2B-BQ12491 THI3YDL080C 1830 nt12.35□□□□□ -0.43
TY2B-BQ12491 COQ8YGL119W 1506 nt12.34□□□□□ -0.43
TY2B-BQ12491 SLM3YDL033C 1254 nt12.33□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt12.33□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 ATP23YNR020C 813 nt12.33□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 MAS2YHR024C 1449 nt12.32□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 LAT1YNL071W 1449 nt12.31□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 DOC1YGL240W 753 nt12.31□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 ESBP6YNL125C 2022 nt12.31□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 ATP2YJR121W 1536 nt12.3□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 THI73YLR004C 1572 nt12.29□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 PUS4YNL292W 1212 nt12.28□□□□□ -0.44
TY2B-BQ12491 PSP2YML017W 1782 nt12.27□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 MCH5YOR306C 1566 nt12.27□□□□□ -0.45
TY2B-BQ12491 PUP3YER094C 618 nt12.27□□□□□ -0.45
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