Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 YGR210CYGR210C 1236 nt10.04□□□□□ -0.8
SNU66Q12420 SRP54YPR088C 1626 nt10.04□□□□□ -0.8
SNU66Q12420 CRC1YOR100C 984 nt10.03□□□□□ -0.8
SNU66Q12420 SGA1YIL099W 1650 nt10.02□□□□□ -0.8
SNU66Q12420 LSR1LSR1 1175 nt10.02□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 YKL133CYKL133C 1392 nt10.01□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 MAS1YLR163C 1389 nt10.01□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 TGA1tA(UGC)A 73 nt10.01□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt10.01□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt10.01□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt10.01□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt10.01□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 MRS6YOR370C 1812 nt10□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 BUD20YLR074C 501 nt9.99□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 SAN1YDR143C 1833 nt9.98□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 SNX3YOR357C 489 nt9.98□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 YFR020WYFR020W 699 nt9.97□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 YPT11YNL304W 1254 nt9.97□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 FCY1YPR062W 477 nt9.97□□□□□ -0.81
SNU66Q12420 RPD3YNL330C 1302 nt9.96□□□□□ -0.82
SNU66Q12420 ZAP1YJL056C 2643 nt9.96□□□□□ -0.82
SNU66Q12420 YPL108WYPL108W 507 nt9.94□□□□□ -0.82
SNU66Q12420 HEL2YDR266C 1920 nt9.94□□□□□ -0.82
SNU66Q12420 KGD2YDR148C 1392 nt9.92□□□□□ -0.82
SNU66Q12420 RIM2YBR192W 1134 nt9.9□□□□□ -0.82
SNU66Q12420 SFP1YLR403W 2052 nt9.89□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 KRR1YCL059C 951 nt9.89□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 HIS2YFR025C 1008 nt9.89□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 PAU21YOR394W 495 nt9.89□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 PAU22YPL282C 495 nt9.89□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 RSC4YKR008W 1878 nt9.88□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 MET2YNL277W 1461 nt9.88□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 YJL160CYJL160C 864 nt9.88□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 YOR343CYOR343C 327 nt9.88□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 UGP1YKL035W 1500 nt9.87□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 CWP2YKL096W-A 279 nt9.87□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 GAS1YMR307W 1680 nt9.87□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 PTC6YCR079W 1329 nt9.86□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 RSM7YJR113C 744 nt9.86□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 EMC3YKL207W 762 nt9.86□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 GRH1YDR517W 1119 nt9.85□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 SBP1YHL034C 885 nt9.85□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 HRA1HRA1 564 nt9.84□□□□□ -0.83
SNU66Q12420 YMR166CYMR166C 1107 nt9.83□□□□□ -0.84
SNU66Q12420 SSL2YIL143C 2532 nt9.83□□□□□ -0.84
SNU66Q12420 LSP1YPL004C 1026 nt9.82□□□□□ -0.84
SNU66Q12420 YMR210WYMR210W 1350 nt9.82□□□□□ -0.84
SNU66Q12420 RPC31YNL151C 756 nt9.81□□□□□ -0.84
SNU66Q12420 RPL12BYDR418W 498 nt9.79□□□□□ -0.84
SNU66Q12420 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.79□□□□□ -0.84
SNU66Q12420 MRP1YDR347W 966 nt9.77□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 GTB1YDR221W 2109 nt9.77□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 RRT14YIL127C 621 nt9.76□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 YLR460CYLR460C 1131 nt9.76□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 ODC1YPL134C 933 nt9.75□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 DPL1YDR294C 1770 nt9.75□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 PET18YCR020C 648 nt9.74□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 CAK1YFL029C 1107 nt9.73□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 GGA2YHR108W 1758 nt9.72□□□□□ -0.85
SNU66Q12420 CHS7YHR142W 951 nt9.71□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.71□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 MET22YOL064C 1074 nt9.71□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 TOK1YJL093C 2076 nt9.71□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 OCH1YGL038C 1443 nt9.71□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 MFT1YML062C 1179 nt9.7□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 GDH1YOR375C 1365 nt9.7□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 THI3YDL080C 1830 nt9.69□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 ADA2YDR448W 1305 nt9.68□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 YER156CYER156C 1017 nt9.68□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 YDR306CYDR306C 1437 nt9.67□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 UTR5YEL035C 501 nt9.66□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 MDM35YKL053C-A 261 nt9.66□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 OLA1YBR025C 1185 nt9.66□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 GAL2YLR081W 1725 nt9.65□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 GPM1YKL152C 744 nt9.65□□□□□ -0.86
SNU66Q12420 YOR268CYOR268C 399 nt9.64□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 PDC6YGR087C 1692 nt9.64□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 GNP1YDR508C 1992 nt9.63□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 TAD2YJL035C 753 nt9.63□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 SUP51tL(UAA)J 84 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 YIR035CYIR035C 765 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 RNA170RNA170 169 nt9.62□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 YJR149WYJR149W 1215 nt9.61□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 LEU4YNL104C 1860 nt9.6□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 YDR467CYDR467C 327 nt9.6□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 YPR084WYPR084W 1371 nt9.6□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 EDC2YER035W 438 nt9.59□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 BXI1YNL305C 894 nt9.59□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 RPS6AYPL090C 711 nt9.59□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 RPS6BYBR181C 711 nt9.59□□□□□ -0.87
SNU66Q12420 PUS7YOR243C 2031 nt9.58□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 ELP4YPL101W 1371 nt9.58□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 YGL114WYGL114W 2178 nt9.58□□□□□ -0.88
SNU66Q12420 AAC3YBR085W 924 nt9.57□□□□□ -0.88
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