Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 RIM2YBR192W 1134 nt7.72□□□□□ -1.17
NPC2Q12408 DPL1YDR294C 1770 nt7.71□□□□□ -1.17
NPC2Q12408 KRR1YCL059C 951 nt7.71□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 YKL053WYKL053W 375 nt7.71□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 SEN2YLR105C 1134 nt7.71□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 snR31snR31 225 nt7.71□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 LEU2YCL018W 1095 nt7.71□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 FSH2YMR222C 672 nt7.7□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 SPE2YOL052C 1191 nt7.7□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 NAM8YHR086W 1572 nt7.69□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 DMA2YNL116W 1569 nt7.69□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 MET2YNL277W 1461 nt7.68□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 SEM1YDR363W-A 270 nt7.68□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 KRE1YNL322C 942 nt7.68□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 KDX1YKL161C 1302 nt7.68□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 SAN1YDR143C 1833 nt7.67□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 YJL064WYJL064W 396 nt7.67□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 PHB2YGR231C 933 nt7.66□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 KGD2YDR148C 1392 nt7.66□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 CYT1YOR065W 930 nt7.65□□□□□ -1.18
NPC2Q12408 PSD1YNL169C 1503 nt7.64□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 MAS1YLR163C 1389 nt7.64□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 REX2YLR059C 810 nt7.64□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 ADH3YMR083W 1128 nt7.64□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 PAU19YMR325W 375 nt7.64□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 YHR218WYHR218W 1812 nt7.64□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 SRP54YPR088C 1626 nt7.63□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 NAP1YKR048C 1254 nt7.62□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 HXT10YFL011W 1641 nt7.61□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 PUP1YOR157C 786 nt7.61□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 IPL1YPL209C 1104 nt7.61□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 SDS24YBR214W 1584 nt7.61□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 YHL008CYHL008C 1884 nt7.61□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 LEU4YNL104C 1860 nt7.6□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 FLX1YIL134W 936 nt7.6□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 YKR012CYKR012C 378 nt7.6□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 SWP1YMR149W 861 nt7.6□□□□□ -1.19
NPC2Q12408 VBA3YCL069W 1377 nt7.59□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 SBP1YHL034C 885 nt7.57□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 YNL165WYNL165W 1221 nt7.57□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 THI3YDL080C 1830 nt7.57□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 BSP1YPR171W 1731 nt7.56□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.56□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 AGP3YFL055W 1677 nt7.56□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.55□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.55□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 SKG1YKR100C 1068 nt7.55□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 GAS1YMR307W 1680 nt7.54□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 MOB1YIL106W 945 nt7.54□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 GPM1YKL152C 744 nt7.54□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 AST1YBL069W 1290 nt7.54□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 YPT11YNL304W 1254 nt7.54□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 PTC6YCR079W 1329 nt7.53□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 YDR467CYDR467C 327 nt7.53□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 GGA2YHR108W 1758 nt7.53□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 SFP1YLR403W 2052 nt7.53□□□□□ -1.2
NPC2Q12408 ENO1YGR254W 1314 nt7.52□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 YCR025CYCR025C 411 nt7.51□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 INH1YDL181W 258 nt7.51□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 YJL107CYJL107C 1164 nt7.51□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 HOS2YGL194C 1359 nt7.5□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 CYC3YAL039C 810 nt7.5□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 SLG1YOR008C 1137 nt7.5□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 NPP2YEL016C 1482 nt7.49□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 YFR020WYFR020W 699 nt7.49□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 RMA1YKL132C 1293 nt7.49□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 SRP102YKL154W 735 nt7.49□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 YDR306CYDR306C 1437 nt7.49□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 EEB1YPL095C 1371 nt7.48□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 LYS20YDL182W 1287 nt7.48□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 PET20YPL159C 762 nt7.48□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 HMG2YLR450W 3138 nt7.47□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 YJL211CYJL211C 444 nt7.47□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 YBL095WYBL095W 813 nt7.47□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 PUS7YOR243C 2031 nt7.47□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 TPO4YOR273C 1980 nt7.46□□□□□ -1.21
NPC2Q12408 SER2YGR208W 930 nt7.46□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 YNR068CYNR068C 819 nt7.46□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 RSM23YGL129C 1353 nt7.46□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 Q0144Q0144 330 nt7.45□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 YLR280CYLR280C 351 nt7.45□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 AAC3YBR085W 924 nt7.45□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 ERO1YML130C 1692 nt7.44□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 snR78snR78 87 nt7.44□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 SWM1YDR260C 513 nt7.44□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 COX16YJL003W 357 nt7.43□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 RSM7YJR113C 744 nt7.43□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 APM1YPL259C 1428 nt7.43□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 HXK1YFR053C 1458 nt7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.8 ms