Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 MET1YKR069W 1782 nt9.57□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 SGA1YIL099W 1650 nt9.56□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 SDS24YBR214W 1584 nt9.56□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 REX2YLR059C 810 nt9.56□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 HIS2YFR025C 1008 nt9.55□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 YKL053WYKL053W 375 nt9.55□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 RCR1YBR005W 642 nt9.55□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 RPD3YNL330C 1302 nt9.55□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 SUV3YPL029W 2214 nt9.54□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 HTS1YPR033C 1641 nt9.54□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 SRP54YPR088C 1626 nt9.54□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 YMR007WYMR007W 381 nt9.54□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 SNX3YOR357C 489 nt9.54□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 SFL1YOR140W 2301 nt9.54□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 MRS6YOR370C 1812 nt9.54□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 YHR219WYHR219W 1875 nt9.53□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 YMR209CYMR209C 1374 nt9.53□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 UGP1YKL035W 1500 nt9.52□□□□□ -0.88
CLF1Q12309 YLR280CYLR280C 351 nt9.52□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 CRC1YOR100C 984 nt9.52□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 SRP102YKL154W 735 nt9.51□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 SWM1YDR260C 513 nt9.49□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 FCY1YPR062W 477 nt9.49□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 VBA3YCL069W 1377 nt9.49□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.48□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.48□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.48□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.48□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.48□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 YPT11YNL304W 1254 nt9.48□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 ERO1YML130C 1692 nt9.48□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 YGR210CYGR210C 1236 nt9.47□□□□□ -0.89
CLF1Q12309 MAS1YLR163C 1389 nt9.45□□□□□ -0.9
CLF1Q12309 KRR1YCL059C 951 nt9.43□□□□□ -0.9
CLF1Q12309 RSM7YJR113C 744 nt9.43□□□□□ -0.9
CLF1Q12309 SAN1YDR143C 1833 nt9.42□□□□□ -0.9
CLF1Q12309 KGD2YDR148C 1392 nt9.42□□□□□ -0.9
CLF1Q12309 POP2YNR052C 1302 nt9.41□□□□□ -0.9
CLF1Q12309 SBP1YHL034C 885 nt9.41□□□□□ -0.9
CLF1Q12309 RIM2YBR192W 1134 nt9.4□□□□□ -0.9
CLF1Q12309 GAS1YMR307W 1680 nt9.39□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 PTC6YCR079W 1329 nt9.39□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 ZAP1YJL056C 2643 nt9.39□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 YFR020WYFR020W 699 nt9.38□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 CWP2YKL096W-A 279 nt9.37□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 RPC31YNL151C 756 nt9.37□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.36□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 YPL108WYPL108W 507 nt9.35□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 Q0010Q0010 387 nt9.35□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 YLR173WYLR173W 1827 nt9.34□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 NSG2YNL156C 900 nt9.34□□□□□ -0.91
CLF1Q12309 GNP1YDR508C 1992 nt9.33□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 YLR460CYLR460C 1131 nt9.33□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 ODC1YPL134C 933 nt9.32□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 SSL2YIL143C 2532 nt9.31□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 LSP1YPL004C 1026 nt9.31□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 BUD20YLR074C 501 nt9.3□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 TOM71YHR117W 1920 nt9.3□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 PSD1YNL169C 1503 nt9.29□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 YMR166CYMR166C 1107 nt9.28□□□□□ -0.92
CLF1Q12309 YGR139WYGR139W 339 nt9.27□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 GGA2YHR108W 1758 nt9.27□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 EMC3YKL207W 762 nt9.26□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 TPN1YGL186C 1740 nt9.25□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 YDR467CYDR467C 327 nt9.25□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 CHS7YHR142W 951 nt9.25□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 YJL160CYJL160C 864 nt9.25□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 MTO1YGL236C 2010 nt9.24□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 GRH1YDR517W 1119 nt9.24□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 MDM35YKL053C-A 261 nt9.24□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 YMR210WYMR210W 1350 nt9.24□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 OLA1YBR025C 1185 nt9.23□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 DPL1YDR294C 1770 nt9.22□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 DMA2YNL116W 1569 nt9.22□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 HRA1HRA1 564 nt9.22□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 GPM1YKL152C 744 nt9.22□□□□□ -0.93
CLF1Q12309 RRT14YIL127C 621 nt9.21□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 YHL008CYHL008C 1884 nt9.21□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 CAK1YFL029C 1107 nt9.2□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 MFT1YML062C 1179 nt9.19□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 YOR343CYOR343C 327 nt9.19□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 PAU21YOR394W 495 nt9.19□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 PAU22YPL282C 495 nt9.19□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 THI6YPL214C 1623 nt9.19□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 INH1YDL181W 258 nt9.18□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.18□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 THI3YDL080C 1830 nt9.17□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 RTG2YGL252C 1767 nt9.17□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 YMC2YBR104W 990 nt9.17□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 LEU4YNL104C 1860 nt9.17□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 YDR306CYDR306C 1437 nt9.16□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 OCH1YGL038C 1443 nt9.16□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 YJR154WYJR154W 1041 nt9.16□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 MET22YOL064C 1074 nt9.16□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 YPR084WYPR084W 1371 nt9.15□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 YIR035CYIR035C 765 nt9.15□□□□□ -0.94
CLF1Q12309 ALR1YOL130W 2580 nt9.15□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 YHR218WYHR218W 1812 nt9.15□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 YJR149WYJR149W 1215 nt9.14□□□□□ -0.95
CLF1Q12309 YBL095WYBL095W 813 nt9.14□□□□□ -0.95
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