Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 RIM8YGL045W 1629 nt9.78□□□□□ -0.84
SSF2Q12153 REX2YLR059C 810 nt9.77□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 SRP54YPR088C 1626 nt9.76□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 SSL2YIL143C 2532 nt9.76□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 HSL7YBR133C 2484 nt9.75□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 CWP2YKL096W-A 279 nt9.75□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 ODC1YPL134C 933 nt9.75□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 SFP1YLR403W 2052 nt9.75□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 SDS24YBR214W 1584 nt9.74□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 CYC3YAL039C 810 nt9.73□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 RIM2YBR192W 1134 nt9.73□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 GNP1YDR508C 1992 nt9.73□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 RPC31YNL151C 756 nt9.72□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 YGL114WYGL114W 2178 nt9.71□□□□□ -0.85
SSF2Q12153 ENO1YGR254W 1314 nt9.71□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 KGD2YDR148C 1392 nt9.71□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 KRR1YCL059C 951 nt9.7□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 PAU21YOR394W 495 nt9.7□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 PAU22YPL282C 495 nt9.7□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 SAN1YDR143C 1833 nt9.7□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 SAM50YNL026W 1455 nt9.68□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 YCP4YCR004C 744 nt9.68□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt9.68□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 COG1YGL223C 1254 nt9.68□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 VBA3YCL069W 1377 nt9.67□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 LYS20YDL182W 1287 nt9.67□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 GTB1YDR221W 2109 nt9.67□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 YMR209CYMR209C 1374 nt9.66□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 SER2YGR208W 930 nt9.66□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 SBP1YHL034C 885 nt9.65□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 YPT11YNL304W 1254 nt9.65□□□□□ -0.86
SSF2Q12153 MET2YNL277W 1461 nt9.65□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 MDM35YKL053C-A 261 nt9.64□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 YLR280CYLR280C 351 nt9.64□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 TOK1YJL093C 2076 nt9.63□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 PTC6YCR079W 1329 nt9.62□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 GAS1YMR307W 1680 nt9.62□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 SRP102YKL154W 735 nt9.62□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 DPL1YDR294C 1770 nt9.62□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 HTS1YPR033C 1641 nt9.6□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 ERO1YML130C 1692 nt9.6□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 GAL2YLR081W 1725 nt9.59□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 ARO7YPR060C 771 nt9.59□□□□□ -0.87
SSF2Q12153 DMA2YNL116W 1569 nt9.58□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.58□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.58□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.58□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.58□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.58□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 RSM7YJR113C 744 nt9.58□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 YIA6YIL006W 1122 nt9.57□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 SWM1YDR260C 513 nt9.56□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 YDR467CYDR467C 327 nt9.56□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 YFR020WYFR020W 699 nt9.56□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 YGR210CYGR210C 1236 nt9.56□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 URH1YDR400W 1023 nt9.55□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 RIB1YBL033C 1038 nt9.55□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 FCY1YPR062W 477 nt9.55□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 GGA2YHR108W 1758 nt9.55□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 LEU4YNL104C 1860 nt9.54□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 SOD2YHR008C 702 nt9.54□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 GPM1YKL152C 744 nt9.53□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 YMR007WYMR007W 381 nt9.53□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 FTH1YBR207W 1398 nt9.52□□□□□ -0.88
SSF2Q12153 FAF1YIL019W 1041 nt9.51□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 THI3YDL080C 1830 nt9.51□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 FRA1YLL029W 2250 nt9.51□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 RCR1YBR005W 642 nt9.5□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 INH1YDL181W 258 nt9.49□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.49□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 CYT1YOR065W 930 nt9.49□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 PSD1YNL169C 1503 nt9.48□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 HXT10YFL011W 1641 nt9.48□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 ERG6YML008C 1152 nt9.47□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 YPL108WYPL108W 507 nt9.47□□□□□ -0.89
SSF2Q12153 LCP5YER127W 1074 nt9.46□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 YLR460CYLR460C 1131 nt9.46□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 YBL095WYBL095W 813 nt9.45□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.44□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.44□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 YTH1YPR107C 627 nt9.44□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 YMC2YBR104W 990 nt9.44□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 YMR166CYMR166C 1107 nt9.42□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 LSP1YPL004C 1026 nt9.42□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 AGP3YFL055W 1677 nt9.41□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 YHR218WYHR218W 1812 nt9.4□□□□□ -0.9
SSF2Q12153 CHS7YHR142W 951 nt9.39□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 NPP2YEL016C 1482 nt9.39□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.38□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 MRS4YKR052C 915 nt9.38□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 OLA1YBR025C 1185 nt9.37□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 AAC3YBR085W 924 nt9.37□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 YRF1-2YER190W 5046 nt9.36□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 YIR035CYIR035C 765 nt9.36□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 MET22YOL064C 1074 nt9.36□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 CBK1YNL161W 2271 nt9.36□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 HEL2YDR266C 1920 nt9.36□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 TMS1YDR105C 1422 nt9.35□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 CAK1YFL029C 1107 nt9.35□□□□□ -0.91
SSF2Q12153 YJL160CYJL160C 864 nt9.35□□□□□ -0.91
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