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Protein–RNA interactions for Protein: Q12090
REX3, RNA exonuclease 3, yeast
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404 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
REX3
Q12090
tA(AGC)L
tA(AGC)L
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)M1
tA(AGC)M1
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)M2
tA(AGC)M2
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
tA(AGC)P
tA(AGC)P
73 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
HIS2
YFR025C
1008 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
PCP1
YGR101W
1041 nt
7.83
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
YCP4
YCR004C
744 nt
7.82
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
KEL3
YPL263C
1956 nt
7.82
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
NAS6
YGR232W
687 nt
7.81
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
MOB1
YIL106W
945 nt
7.81
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
YOR072W
YOR072W
315 nt
7.81
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
snR31
snR31
225 nt
7.81
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
SAC7
YDR389W
1965 nt
7.8
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
PSD1
YNL169C
1503 nt
7.8
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
YIA6
YIL006W
1122 nt
7.8
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
YKR012C
YKR012C
378 nt
7.8
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
RIB1
YBL033C
1038 nt
7.8
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
COQ8
YGL119W
1506 nt
7.79
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
RPN14
YGL004C
1254 nt
7.79
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
NAS2
YIL007C
663 nt
7.79
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
CYC3
YAL039C
810 nt
7.79
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
ARO8
YGL202W
1503 nt
7.78
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
UGP1
YKL035W
1500 nt
7.78
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
SOD2
YHR008C
702 nt
7.78
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
FLX1
YIL134W
936 nt
7.78
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
ELO1
YJL196C
933 nt
7.78
□□□□□ -1.16
REX3
Q12090
SAM50
YNL026W
1455 nt
7.77
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
KES1
YPL145C
1305 nt
7.77
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
NAM8
YHR086W
1572 nt
7.76
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
ADH3
YMR083W
1128 nt
7.75
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
DLD3
YEL071W
1491 nt
7.75
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
GID8
YMR135C
1368 nt
7.74
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
RCR1
YBR005W
642 nt
7.74
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
ENO1
YGR254W
1314 nt
7.74
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
VMA11
YPL234C
495 nt
7.73
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
HAP5
YOR358W
729 nt
7.72
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
ITR2
YOL103W
1830 nt
7.71
□□□□□ -1.17
REX3
Q12090
UFD1
YGR048W
1086 nt
7.71
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
PHB2
YGR231C
933 nt
7.71
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
YMR265C
YMR265C
1386 nt
7.71
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
YMR007W
YMR007W
381 nt
7.7
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
RPD3
YNL330C
1302 nt
7.7
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
YKL133C
YKL133C
1392 nt
7.7
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
SER2
YGR208W
930 nt
7.69
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
REX2
YLR059C
810 nt
7.69
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
SWT21
YNL187W
1074 nt
7.69
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
HTS1
YPR033C
1641 nt
7.69
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
SGA1
YIL099W
1650 nt
7.69
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
MEX67
YPL169C
1800 nt
7.68
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
SRP54
YPR088C
1626 nt
7.68
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
LYS20
YDL182W
1287 nt
7.68
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
CDD1
YLR245C
429 nt
7.68
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
ERG6
YML008C
1152 nt
7.68
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
CYT1
YOR065W
930 nt
7.68
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
SNX3
YOR357C
489 nt
7.68
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
SDS24
YBR214W
1584 nt
7.67
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
MET1
YKR069W
1782 nt
7.67
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
SRP102
YKL154W
735 nt
7.66
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
YLR280C
YLR280C
351 nt
7.66
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
LSR1
LSR1
1175 nt
7.66
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
YPT11
YNL304W
1254 nt
7.66
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
NDE1
YMR145C
1683 nt
7.65
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
SUV3
YPL029W
2214 nt
7.65
□□□□□ -1.18
REX3
Q12090
KRR1
YCL059C
951 nt
7.64
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
YKL053W
YKL053W
375 nt
7.64
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
CCR4
YAL021C
2514 nt
7.64
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
RSM7
YJR113C
744 nt
7.63
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
CRC1
YOR100C
984 nt
7.63
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
FCY1
YPR062W
477 nt
7.63
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
RIM2
YBR192W
1134 nt
7.63
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
MRS6
YOR370C
1812 nt
7.63
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
DMA2
YNL116W
1569 nt
7.63
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
YHR219W
YHR219W
1875 nt
7.62
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
ERO1
YML130C
1692 nt
7.62
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
VBA3
YCL069W
1377 nt
7.61
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
ZAP1
YJL056C
2643 nt
7.6
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
YGR210C
YGR210C
1236 nt
7.6
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
MET30
YIL046W
1923 nt
7.59
□□□□□ -1.19
REX3
Q12090
TGA1
tA(UGC)A
73 nt
7.58
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
tA(UGC)E
tA(UGC)E
73 nt
7.58
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
tA(UGC)G
tA(UGC)G
73 nt
7.58
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
tA(UGC)L
tA(UGC)L
73 nt
7.58
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
tA(UGC)O
tA(UGC)O
73 nt
7.58
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
SWM1
YDR260C
513 nt
7.58
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
SBP1
YHL034C
885 nt
7.58
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
YLR460C
YLR460C
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7.57
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
YNL190W
YNL190W
615 nt
7.57
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
FIT1
YDR534C
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7.57
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
PAB1
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□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
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YMR307W
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□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
KGD2
YDR148C
1392 nt
7.56
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
PTC6
YCR079W
1329 nt
7.55
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
POP2
YNR052C
1302 nt
7.55
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
SAN1
YDR143C
1833 nt
7.55
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
PMA2
YPL036W
2844 nt
7.55
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
DAL7
YIR031C
1665 nt
7.54
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
YFR020W
YFR020W
699 nt
7.54
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
CWP2
YKL096W-A
279 nt
7.54
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
RPC31
YNL151C
756 nt
7.54
□□□□□ -1.2
REX3
Q12090
FRT1
YOR324C
1809 nt
7.54
□□□□□ -1.2
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