Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 ADH3YMR083W 1128 nt8.37□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 FSH2YMR222C 672 nt8.37□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 SWT21YNL187W 1074 nt8.37□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 LSR1LSR1 1175 nt8.37□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 LEU2YCL018W 1095 nt8.37□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 YCR025CYCR025C 411 nt8.36□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 FLX1YIL134W 936 nt8.36□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 NSG2YNL156C 900 nt8.36□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 YRF1-2YER190W 5046 nt8.36□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 SUV3YPL029W 2214 nt8.35□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 NAM8YHR086W 1572 nt8.35□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 VMA11YPL234C 495 nt8.34□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 MET1YKR069W 1782 nt8.34□□□□□ -1.07
SMF3Q12078 YLR173WYLR173W 1827 nt8.33□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 YKR012CYKR012C 378 nt8.33□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 YMR265CYMR265C 1386 nt8.33□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 MOB1YIL106W 945 nt8.32□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 CWP2YKL096W-A 279 nt8.32□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 HAP5YOR358W 729 nt8.32□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 YKL053WYKL053W 375 nt8.3□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 YCP4YCR004C 744 nt8.29□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 CRC1YOR100C 984 nt8.29□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 snR31snR31 225 nt8.29□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 SAM50YNL026W 1455 nt8.29□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 RPD3YNL330C 1302 nt8.29□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 LYS20YDL182W 1287 nt8.28□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 SNX3YOR357C 489 nt8.28□□□□□ -1.08
SMF3Q12078 RPN14YGL004C 1254 nt8.27□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 SDS24YBR214W 1584 nt8.27□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 SNU66YOR308C 1764 nt8.26□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 NBA1YOL070C 1506 nt8.26□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 REX2YLR059C 810 nt8.26□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 AGP3YFL055W 1677 nt8.25□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 MEX67YPL169C 1800 nt8.25□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 CYC3YAL039C 810 nt8.25□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 SRP54YPR088C 1626 nt8.24□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 VBA3YCL069W 1377 nt8.23□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 SWM1YDR260C 513 nt8.23□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 SER2YGR208W 930 nt8.23□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 YIA6YIL006W 1122 nt8.22□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 RIM2YBR192W 1134 nt8.22□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 ENO1YGR254W 1314 nt8.22□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 SAN1YDR143C 1833 nt8.22□□□□□ -1.09
SMF3Q12078 RIB1YBL033C 1038 nt8.21□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 KGD2YDR148C 1392 nt8.2□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 SOD2YHR008C 702 nt8.19□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 SRP102YKL154W 735 nt8.18□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 YLR280CYLR280C 351 nt8.18□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 HTS1YPR033C 1641 nt8.18□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 ADE2YOR128C 1716 nt8.17□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 ERG6YML008C 1152 nt8.17□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 AAC3YBR085W 924 nt8.17□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 ERO1YML130C 1692 nt8.17□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.16□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.16□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.16□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.16□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.16□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 RPC31YNL151C 756 nt8.16□□□□□ -1.1
SMF3Q12078 INH1YDL181W 258 nt8.14□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 YGR210CYGR210C 1236 nt8.14□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 YPT11YNL304W 1254 nt8.14□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 MDL2YPL270W 2322 nt8.14□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 SBP1YHL034C 885 nt8.13□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 YMR007WYMR007W 381 nt8.13□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 MIM1YOL026C 342 nt8.13□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 DPL1YDR294C 1770 nt8.12□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 RTG2YGL252C 1767 nt8.12□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 GAS1YMR307W 1680 nt8.12□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 KRR1YCL059C 951 nt8.12□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 YFR020WYFR020W 699 nt8.12□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 PTC6YCR079W 1329 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 FCY1YPR062W 477 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 TOM71YHR117W 1920 nt8.11□□□□□ -1.11
SMF3Q12078 LEU4YNL104C 1860 nt8.08□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 RCR1YBR005W 642 nt8.07□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 YPL108WYPL108W 507 nt8.07□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 YJL045WYJL045W 1905 nt8.06□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 RSM7YJR113C 744 nt8.06□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 HBS1YKR084C 1836 nt8.05□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 MTO1YGL236C 2010 nt8.05□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 YHR131CYHR131C 2553 nt8.05□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 POP2YNR052C 1302 nt8.04□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 THI3YDL080C 1830 nt8.04□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.04□□□□□ -1.12
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