Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND3P61587 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND3P61587 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND3P61587 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RND3P61587 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RND3P61587 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RND3P61587 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RND3P61587 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RND3P61587 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RND3P61587 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RND3P61587 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RND3P61587 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RND3P61587 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RND3P61587 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RND3P61587 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RND3P61587 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RND3P61587 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RND3P61587 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RND3P61587 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RND3P61587 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RND3P61587 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RND3P61587 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RND3P61587 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RND3P61587 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RND3P61587 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RND3P61587 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RND3P61587 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RND3P61587 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RND3P61587 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RND3P61587 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RND3P61587 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RND3P61587 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RND3P61587 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND3P61587 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND3P61587 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND3P61587 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND3P61587 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RND3P61587 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND3P61587 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND3P61587 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND3P61587 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND3P61587 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RND3P61587 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RND3P61587 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RND3P61587 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RND3P61587 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RND3P61587 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RND3P61587 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RND3P61587 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND3P61587 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND3P61587 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND3P61587 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND3P61587 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND3P61587 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RND3P61587 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RND3P61587 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RND3P61587 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RND3P61587 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RND3P61587 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RND3P61587 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND3P61587 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND3P61587 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RND3P61587 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RND3P61587 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RND3P61587 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RND3P61587 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RND3P61587 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RND3P61587 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RND3P61587 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RND3P61587 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RND3P61587 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RND3P61587 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RND3P61587 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RND3P61587 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND3P61587 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND3P61587 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND3P61587 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND3P61587 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RND3P61587 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RND3P61587 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RND3P61587 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RND3P61587 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RND3P61587 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RND3P61587 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RND3P61587 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RND3P61587 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RND3P61587 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RND3P61587 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RND3P61587 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RND3P61587 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RND3P61587 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RND3P61587 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms