Protein–RNA interactions for Protein: P60953

CDC42, Cell division control protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42P60953 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42P60953 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42P60953 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42P60953 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDC42P60953 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42P60953 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDC42P60953 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDC42P60953 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42P60953 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42P60953 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42P60953 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42P60953 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42P60953 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42P60953 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42P60953 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDC42P60953 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42P60953 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDC42P60953 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42P60953 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42P60953 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC42P60953 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42P60953 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC42P60953 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42P60953 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42P60953 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC42P60953 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDC42P60953 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42P60953 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42P60953 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42P60953 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC42P60953 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42P60953 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42P60953 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42P60953 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC42P60953 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42P60953 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42P60953 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42P60953 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42P60953 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42P60953 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42P60953 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42P60953 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC42P60953 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42P60953 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42P60953 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42P60953 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42P60953 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42P60953 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42P60953 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC42P60953 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42P60953 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC42P60953 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC42P60953 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC42P60953 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42P60953 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42P60953 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC42P60953 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42P60953 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42P60953 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42P60953 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42P60953 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC42P60953 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42P60953 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42P60953 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42P60953 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC42P60953 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42P60953 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42P60953 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC42P60953 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42P60953 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42P60953 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42P60953 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42P60953 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42P60953 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42P60953 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC42P60953 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42P60953 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC42P60953 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42P60953 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC42P60953 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42P60953 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42P60953 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC42P60953 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42P60953 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC42P60953 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42P60953 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42P60953 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42P60953 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC42P60953 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42P60953 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42P60953 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42P60953 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42P60953 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42P60953 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC42P60953 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42P60953 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42P60953 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42P60953 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42P60953 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC42P60953 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms