Protein–RNA interactions for Protein: P42826

XKS1, Xylulose kinase, yeastyeast

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XKS1P42826 YKL053WYKL053W 375 nt10.67□□□□□ -0.7
XKS1P42826 CCT2YIL142W 1584 nt10.67□□□□□ -0.7
XKS1P42826 YFR020WYFR020W 699 nt10.66□□□□□ -0.7
XKS1P42826 YOR325WYOR325W 474 nt10.65□□□□□ -0.7
XKS1P42826 SRP54YPR088C 1626 nt10.65□□□□□ -0.7
XKS1P42826 ADA2YDR448W 1305 nt10.64□□□□□ -0.71
XKS1P42826 LSP1YPL004C 1026 nt10.64□□□□□ -0.71
XKS1P42826 UTR5YEL035C 501 nt10.63□□□□□ -0.71
XKS1P42826 CSM2YIL132C 642 nt10.63□□□□□ -0.71
XKS1P42826 NAR1YNL240C 1476 nt10.62□□□□□ -0.71
XKS1P42826 SUV3YPL029W 2214 nt10.61□□□□□ -0.71
XKS1P42826 ITR2YOL103W 1830 nt10.61□□□□□ -0.71
XKS1P42826 BAP3YDR046C 1815 nt10.61□□□□□ -0.71
XKS1P42826 MCH5YOR306C 1566 nt10.6□□□□□ -0.71
XKS1P42826 YAT1YAR035W 2064 nt10.59□□□□□ -0.71
XKS1P42826 YMR166CYMR166C 1107 nt10.59□□□□□ -0.71
XKS1P42826 OPI10YOL032W 741 nt10.59□□□□□ -0.71
XKS1P42826 INA1YLR413W 2028 nt10.58□□□□□ -0.72
XKS1P42826 YPL247CYPL247C 1572 nt10.58□□□□□ -0.72
XKS1P42826 PRE5YMR314W 705 nt10.58□□□□□ -0.72
XKS1P42826 TAD2YJL035C 753 nt10.57□□□□□ -0.72
XKS1P42826 YJR149WYJR149W 1215 nt10.57□□□□□ -0.72
XKS1P42826 snR31snR31 225 nt10.57□□□□□ -0.72
XKS1P42826 ELP4YPL101W 1371 nt10.56□□□□□ -0.72
XKS1P42826 CRC1YOR100C 984 nt10.56□□□□□ -0.72
XKS1P42826 SDH8YBR269C 417 nt10.56□□□□□ -0.72
XKS1P42826 MFT1YML062C 1179 nt10.55□□□□□ -0.72
XKS1P42826 YPT11YNL304W 1254 nt10.55□□□□□ -0.72
XKS1P42826 HAP5YOR358W 729 nt10.55□□□□□ -0.72
XKS1P42826 SAN1YDR143C 1833 nt10.55□□□□□ -0.72
XKS1P42826 DLD3YEL071W 1491 nt10.55□□□□□ -0.72
XKS1P42826 ILV3YJR016C 1758 nt10.54□□□□□ -0.72
XKS1P42826 YMR265CYMR265C 1386 nt10.53□□□□□ -0.72
XKS1P42826 MET8YBR213W 825 nt10.53□□□□□ -0.72
XKS1P42826 RPC82YPR190C 1965 nt10.53□□□□□ -0.72
XKS1P42826 YER156CYER156C 1017 nt10.49□□□□□ -0.73
XKS1P42826 ADE1YAR015W 921 nt10.49□□□□□ -0.73
XKS1P42826 RRT14YIL127C 621 nt10.48□□□□□ -0.73
XKS1P42826 CAK1YFL029C 1107 nt10.47□□□□□ -0.73
XKS1P42826 RPN14YGL004C 1254 nt10.46□□□□□ -0.73
XKS1P42826 RSM7YJR113C 744 nt10.46□□□□□ -0.73
XKS1P42826 FUS3YBL016W 1062 nt10.45□□□□□ -0.74
XKS1P42826 PET494YNR045W 1470 nt10.44□□□□□ -0.74
XKS1P42826 KGD2YDR148C 1392 nt10.44□□□□□ -0.74
XKS1P42826 YJL043WYJL043W 774 nt10.44□□□□□ -0.74
XKS1P42826 PTC6YCR079W 1329 nt10.42□□□□□ -0.74
XKS1P42826 RPS6AYPL090C 711 nt10.42□□□□□ -0.74
XKS1P42826 VMA11YPL234C 495 nt10.42□□□□□ -0.74
XKS1P42826 RPS6BYBR181C 711 nt10.42□□□□□ -0.74
XKS1P42826 GAS1YMR307W 1680 nt10.41□□□□□ -0.74
XKS1P42826 LSR1LSR1 1175 nt10.41□□□□□ -0.74
XKS1P42826 OCH1YGL038C 1443 nt10.41□□□□□ -0.74
XKS1P42826 YHR219WYHR219W 1875 nt10.4□□□□□ -0.75
XKS1P42826 BXI1YNL305C 894 nt10.39□□□□□ -0.75
XKS1P42826 GID8YMR135C 1368 nt10.39□□□□□ -0.75
XKS1P42826 ARO8YGL202W 1503 nt10.38□□□□□ -0.75
XKS1P42826 TDH1YJL052W 999 nt10.36□□□□□ -0.75
XKS1P42826 MET22YOL064C 1074 nt10.36□□□□□ -0.75
XKS1P42826 YPR084WYPR084W 1371 nt10.36□□□□□ -0.75
XKS1P42826 NUP53YMR153W 1428 nt10.35□□□□□ -0.75
XKS1P42826 YLR460CYLR460C 1131 nt10.35□□□□□ -0.75
XKS1P42826 SNX3YOR357C 489 nt10.35□□□□□ -0.75
XKS1P42826 SBP1YHL034C 885 nt10.33□□□□□ -0.76
XKS1P42826 MRS6YOR370C 1812 nt10.32□□□□□ -0.76
XKS1P42826 MUP1YGR055W 1725 nt10.31□□□□□ -0.76
XKS1P42826 CHS7YHR142W 951 nt10.31□□□□□ -0.76
XKS1P42826 YKL133CYKL133C 1392 nt10.3□□□□□ -0.76
XKS1P42826 ATP2YJR121W 1536 nt10.3□□□□□ -0.76
XKS1P42826 KES1YPL145C 1305 nt10.3□□□□□ -0.76
XKS1P42826 RPR1RPR1 369 nt10.28□□□□□ -0.76
XKS1P42826 COS10YNR075W 1125 nt10.27□□□□□ -0.77
XKS1P42826 PDC6YGR087C 1692 nt10.27□□□□□ -0.77
XKS1P42826 SPT20YOL148C 1815 nt10.26□□□□□ -0.77
XKS1P42826 RNA170RNA170 169 nt10.25□□□□□ -0.77
XKS1P42826 RPD3YNL330C 1302 nt10.25□□□□□ -0.77
XKS1P42826 COQ8YGL119W 1506 nt10.24□□□□□ -0.77
XKS1P42826 YIL168WYIL168W 384 nt10.24□□□□□ -0.77
XKS1P42826 OLA1YBR025C 1185 nt10.23□□□□□ -0.77
XKS1P42826 RRT6YGL146C 936 nt10.2□□□□□ -0.78
XKS1P42826 SGA1YIL099W 1650 nt10.2□□□□□ -0.78
XKS1P42826 YPT31YER031C 672 nt10.19□□□□□ -0.78
XKS1P42826 YDR476CYDR476C 675 nt10.18□□□□□ -0.78
XKS1P42826 ZAP1YJL056C 2643 nt10.17□□□□□ -0.78
XKS1P42826 YLR358CYLR358C 564 nt10.16□□□□□ -0.78
XKS1P42826 YBL095WYBL095W 813 nt10.15□□□□□ -0.78
XKS1P42826 FRE6YLL051C 2139 nt10.14□□□□□ -0.79
XKS1P42826 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt10.14□□□□□ -0.79
XKS1P42826 Q0010Q0010 387 nt10.14□□□□□ -0.79
XKS1P42826 RHO1YPR165W 630 nt10.13□□□□□ -0.79
XKS1P42826 HOL1YNR055C 1761 nt10.13□□□□□ -0.79
XKS1P42826 HAC1YFL031W 717 nt10.12□□□□□ -0.79
XKS1P42826 YJR154WYJR154W 1041 nt10.12□□□□□ -0.79
XKS1P42826 YML079WYML079W 606 nt10.12□□□□□ -0.79
XKS1P42826 THI3YDL080C 1830 nt10.12□□□□□ -0.79
XKS1P42826 GGA2YHR108W 1758 nt10.11□□□□□ -0.79
XKS1P42826 PSP2YML017W 1782 nt10.11□□□□□ -0.79
XKS1P42826 PUP2YGR253C 783 nt10.11□□□□□ -0.79
XKS1P42826 RPC31YNL151C 756 nt10.11□□□□□ -0.79
XKS1P42826 ARO7YPR060C 771 nt10.11□□□□□ -0.79
XKS1P42826 KRR1YCL059C 951 nt10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.6 ms