Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHI3L1P36222 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHI3L1P36222 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHI3L1P36222 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CHI3L1P36222 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms