Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ECHS1P30084 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ECHS1P30084 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ECHS1P30084 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ECHS1P30084 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ECHS1P30084 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms