Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXB6P17509 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXB6P17509 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXB6P17509 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXB6P17509 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms