Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COX4I1P13073 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COX4I1P13073 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COX4I1P13073 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COX4I1P13073 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COX4I1P13073 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COX4I1P13073 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms