Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SFTPBP07988 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFTPBP07988 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SFTPBP07988 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFTPBP07988 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFTPBP07988 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms