Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LETM1O95202 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LETM1O95202 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LETM1O95202 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LETM1O95202 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LETM1O95202 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LETM1O95202 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
LETM1O95202 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LETM1O95202 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LETM1O95202 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LETM1O95202 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LETM1O95202 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LETM1O95202 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LETM1O95202 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LETM1O95202 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LETM1O95202 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LETM1O95202 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LETM1O95202 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LETM1O95202 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LETM1O95202 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LETM1O95202 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LETM1O95202 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LETM1O95202 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LETM1O95202 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LETM1O95202 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LETM1O95202 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LETM1O95202 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LETM1O95202 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LETM1O95202 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LETM1O95202 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LETM1O95202 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LETM1O95202 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LETM1O95202 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LETM1O95202 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LETM1O95202 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LETM1O95202 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LETM1O95202 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LETM1O95202 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LETM1O95202 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LETM1O95202 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LETM1O95202 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LETM1O95202 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LETM1O95202 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LETM1O95202 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LETM1O95202 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LETM1O95202 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LETM1O95202 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LETM1O95202 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LETM1O95202 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LETM1O95202 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LETM1O95202 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LETM1O95202 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LETM1O95202 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LETM1O95202 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LETM1O95202 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LETM1O95202 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LETM1O95202 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LETM1O95202 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LETM1O95202 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LETM1O95202 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LETM1O95202 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LETM1O95202 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LETM1O95202 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LETM1O95202 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LETM1O95202 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LETM1O95202 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LETM1O95202 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LETM1O95202 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LETM1O95202 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LETM1O95202 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LETM1O95202 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LETM1O95202 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LETM1O95202 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LETM1O95202 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LETM1O95202 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LETM1O95202 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LETM1O95202 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LETM1O95202 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LETM1O95202 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LETM1O95202 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LETM1O95202 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LETM1O95202 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LETM1O95202 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LETM1O95202 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LETM1O95202 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM1O95202 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM1O95202 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LETM1O95202 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LETM1O95202 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
LETM1O95202 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LETM1O95202 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LETM1O95202 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
LETM1O95202 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LETM1O95202 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LETM1O95202 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LETM1O95202 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LETM1O95202 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LETM1O95202 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LETM1O95202 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LETM1O95202 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms