Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CGGBP1Q9UFW8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CGGBP1Q9UFW8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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