Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PFDN5Q99471 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PFDN5Q99471 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms