Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIRT1Q96EB6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIRT1Q96EB6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms