Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms