Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 RAD9YDR217C 3930 nt1.86□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 USO1YDL058W 5373 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 YMR045CYMR045C 5268 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 WAR1YML076C 2835 nt1.85□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 ORC3YLL004W 1851 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 snR64snR64 101 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 RPM2YML091C 3609 nt1.84□□□□□ -2.11
TY1A-NL1Q12391 INO80YGL150C 4470 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 STO1YMR125W 2586 nt1.84□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 GEA2YEL022W 4380 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 NUP170YBL079W 4509 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 FKS1YLR342W 5631 nt1.83□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 SEC31YDL195W 3822 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 AZF1YOR113W 2745 nt1.82□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 ASE1YOR058C 2658 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 NEO1YIL048W 3456 nt1.81□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 PIK1YNL267W 3201 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 BEM3YPL115C 3387 nt1.8□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 KAP122YGL016W 3246 nt1.79□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 UBP3YER151C 2739 nt1.79□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 snR50snR50 90 nt1.78□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 YDL073WYDL073W 2955 nt1.78□□□□□ -2.12
TY1A-NL1Q12391 ROM2YLR371W 4071 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1A-NL1Q12391 NNF2YGR089W 2811 nt1.77□□□□□ -2.13
TY1A-NL1Q12391 YLR422WYLR422W 5799 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1A-NL1Q12391 PRP16YKR086W 3216 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1A-NL1Q12391 SKI3YPR189W 4299 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1A-NL1Q12391 APL3YBL037W 3078 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1A-NL1Q12391 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1A-NL1Q12391 ATG9YDL149W 2994 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1A-NL1Q12391 MGA2YIR033W 3342 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 ANS1YHR126C 480 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 KCS1YDR017C 3153 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 SEC8YPR055W 3198 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 SIR4YDR227W 4077 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 MON2YNL297C 4911 nt1.69□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 tN(GUU)QtN(GUU)Q 71 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 YLR299C-AYLR299C-A 93 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 YCS4YLR272C 3531 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 YKL225WYKL225W 348 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1A-NL1Q12391 SEC3YER008C 4011 nt1.65□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 SAC3YDR159W 3906 nt1.65□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 SWI4YER111C 3282 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 PMD1YER132C 5262 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 YSP1YHR155W 3687 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 YLR399W-AYLR399W-A 105 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 EST1YLR233C 2100 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 IRC20YLR247C 4671 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 CDC25YLR310C 4770 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 TMA7YLR262C-A 195 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 SXM1YDR395W 2835 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 ULP2YIL031W 3105 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 NUP145YGL092W 3954 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 PKH3YDR466W 2697 nt1.6□□□□□ -2.15
TY1A-NL1Q12391 snR69snR69 101 nt1.58□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 FAB1YFR019W 6837 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 PET127YOR017W 2403 nt1.57□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 NUP188YML103C 4968 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 CSE1YGL238W 2883 nt1.56□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 TRM732YMR259C 4263 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 VPS15YBR097W 4365 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt1.54□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 RPL41AYDL184C 78 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 MSN5YDR335W 3675 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 RDS3YPR094W 324 nt1.53□□□□□ -2.16
TY1A-NL1Q12391 MSH3YCR092C 3057 nt1.53□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 BST1YFL025C 3090 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 YML054C-AYML054C-A 159 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 HUG1YML058W-A 207 nt1.52□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 CFT1YDR301W 4074 nt1.5□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 PEP1YBL017C 4740 nt1.48□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 YBR296C-AYBR296C-A 120 nt1.47□□□□□ -2.17
TY1A-NL1Q12391 YDL159W-AYDL159W-A 132 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 YER078W-AYER078W-A 165 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 CDC39YCR093W 6327 nt1.46□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 snR38snR38 95 nt1.45□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 EST2YLR318W 2655 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 SKI7YOR076C 2244 nt1.44□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 SIP4YJL089W 2490 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 snR75snR75 89 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 YJL077W-AYJL077W-A 87 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 YLL006W-AYLL006W-A 177 nt1.42□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 NIP1YMR309C 2439 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 YOR093CYOR093C 4947 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 PAU12YGR294W 363 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 AI1Q0050 2505 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 IRA1YBR140C 9279 nt1.41□□□□□ -2.18
TY1A-NL1Q12391 BUL2YML111W 2763 nt1.4□□□□□ -2.19
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