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Protein–RNA interactions for Protein: Q12334
SCM3, Protein SCM3, yeast
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223 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SCM3
Q12334
YMR172C-A
YMR172C-A
384 nt
0.41
□□□□□ -2.34
SCM3
Q12334
YOR008C-A
YOR008C-A
225 nt
0.41
□□□□□ -2.34
SCM3
Q12334
YDR371C-A
YDR371C-A
105 nt
0.39
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
STF2
YGR008C
255 nt
0.39
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
RPS30B
YOR182C
192 nt
0.39
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
snR74
snR74
88 nt
0.38
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
RPS26A
YGL189C
360 nt
0.38
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
YHR131W-A
YHR131W-A
246 nt
0.38
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
ABF2
YMR072W
552 nt
0.38
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
YDR366C
YDR366C
399 nt
0.36
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
COX12
YLR038C
252 nt
0.36
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
ORC3
YLL004W
1851 nt
0.35
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
YDR524W-C
YDR524W-C
90 nt
0.35
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
SNU13
YEL026W
381 nt
0.35
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
YER053C-A
YER053C-A
114 nt
0.35
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
NIP1
YMR309C
2439 nt
0.34
□□□□□ -2.35
SCM3
Q12334
YLL006W-A
YLL006W-A
177 nt
0.34
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
YNL146W
YNL146W
303 nt
0.34
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
YNL277W-A
YNL277W-A
189 nt
0.34
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
UTP20
YBL004W
7482 nt
0.34
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
HUG1
YML058W-A
207 nt
0.32
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
BIR1
YJR089W
2865 nt
0.31
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
TRS65
YGR166W
1683 nt
0.29
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
YCR038W-A
YCR038W-A
126 nt
0.28
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
YIL002W-A
YIL002W-A
210 nt
0.28
□□□□□ -2.36
SCM3
Q12334
RCO1
YMR075W
2055 nt
0.26
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
YBL100W-B
YBL100W-B
5313 nt
0.26
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0.26
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.26
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
ULP2
YIL031W
3105 nt
0.26
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
MLP2
YIL149C
5040 nt
0.26
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
IQG1
YPL242C
4488 nt
0.25
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
YIR030W-A
YIR030W-A
384 nt
0.25
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
BUL2
YML111W
2763 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
snR65
snR65
100 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
tF(GAA)B
tF(GAA)B
73 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
tF(GAA)F
tF(GAA)F
73 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
tF(GAA)G
tF(GAA)G
73 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
tF(GAA)H1
tF(GAA)H1
73 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
tF(GAA)H2
tF(GAA)H2
73 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
tF(GAA)M
tF(GAA)M
73 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
tF(GAA)P1
tF(GAA)P1
73 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
tF(GAA)P2
tF(GAA)P2
73 nt
0.24
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
UTP8
YGR128C
2142 nt
0.23
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
YPR010C-A
YPR010C-A
219 nt
0.23
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
YBR072C-A
YBR072C-A
162 nt
0.23
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
YOR186C-A
YOR186C-A
210 nt
0.22
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
AI1
Q0050
2505 nt
0.22
□□□□□ -2.37
SCM3
Q12334
MYO1
YHR023W
5787 nt
0.21
□□□□□ -2.38
SCM3
Q12334
YNL054W-B
YNL054W-B
5250 nt
0.2
□□□□□ -2.38
SCM3
Q12334
YLR232W
YLR232W
348 nt
0.2
□□□□□ -2.38
SCM3
Q12334
YBR182C-A
YBR182C-A
195 nt
0.2
□□□□□ -2.38
SCM3
Q12334
YKU70
YMR284W
1809 nt
0.2
□□□□□ -2.38
SCM3
Q12334
tF(GAA)Q
tF(GAA)Q
75 nt
0.17
□□□□□ -2.38
SCM3
Q12334
YEL073C
YEL073C
324 nt
0.17
□□□□□ -2.38
SCM3
Q12334
APQ12
YIL040W
417 nt
0.16
□□□□□ -2.38
SCM3
Q12334
snR55
snR55
98 nt
0.14
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
snR49
snR49
165 nt
0.14
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
YMR158W-B
YMR158W-B
321 nt
0.13
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
GLG1
YKR058W
1851 nt
0.13
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
ESP1
YGR098C
4893 nt
0.13
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
CSE1
YGL238W
2883 nt
0.12
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
YOL014W
YOL014W
375 nt
0.12
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
TAH1
YCR060W
336 nt
0.11
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
SDH6
YDR379C-A
240 nt
0.1
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
YER181C
YER181C
324 nt
0.1
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
YML099W-A
YML099W-A
330 nt
0.1
□□□□□ -2.39
SCM3
Q12334
YGL041C
YGL041C
204 nt
0.08
□□□□□ -2.4
SCM3
Q12334
YPL152W-A
YPL152W-A
99 nt
0.08
□□□□□ -2.4
SCM3
Q12334
YDR544C
YDR544C
429 nt
0.06
□□□□□ -2.4
SCM3
Q12334
QCR9
YGR183C
201 nt
0.04
□□□□□ -2.4
SCM3
Q12334
YOL155W-A
YOL155W-A
135 nt
0.04
□□□□□ -2.4
SCM3
Q12334
YOR231C-A
YOR231C-A
201 nt
0.04
□□□□□ -2.4
SCM3
Q12334
THO2
YNL139C
4794 nt
0.03
□□□□□ -2.4
SCM3
Q12334
PRP39
YML046W
1890 nt
0.03
□□□□□ -2.4
SCM3
Q12334
YBL039C-A
YBL039C-A
84 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCM3
Q12334
YBR131C-A
YBR131C-A
90 nt
0.02
□□□□□ -2.41
SCM3
Q12334
COG6
YNL041C
2520 nt
0
□□□□□ -2.41
SCM3
Q12334
YBR099C
YBR099C
384 nt
0
□□□□□ -2.41
SCM3
Q12334
YER078W-A
YER078W-A
165 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
SCM3
Q12334
SOV1
YMR066W
2697 nt
-0.01
□□□□□ -2.41
SCM3
Q12334
Q0142
Q0142
177 nt
-0.02
□□□□□ -2.41
SCM3
Q12334
snR128
snR128
126 nt
-0.03
□□□□□ -2.41
SCM3
Q12334
YGL182C
YGL182C
324 nt
-0.05
□□□□□ -2.42
SCM3
Q12334
YGL188C-A
YGL188C-A
141 nt
-0.06
□□□□□ -2.42
SCM3
Q12334
YEL014C
YEL014C
306 nt
-0.08
□□□□□ -2.42
SCM3
Q12334
YDR210W
YDR210W
228 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
SCM3
Q12334
YJL182C
YJL182C
318 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
SCM3
Q12334
EST1
YLR233C
2100 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
SCM3
Q12334
YOR314W-A
YOR314W-A
111 nt
-0.09
□□□□□ -2.42
SCM3
Q12334
YOR302W
YOR302W
78 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCM3
Q12334
snR45
snR45
172 nt
-0.11
□□□□□ -2.43
SCM3
Q12334
snR8
snR8
190 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
SCM3
Q12334
YNL097C-B
YNL097C-B
123 nt
-0.12
□□□□□ -2.43
SCM3
Q12334
RPM2
YML091C
3609 nt
-0.13
□□□□□ -2.43
SCM3
Q12334
YOR381W-A
YOR381W-A
168 nt
-0.17
□□□□□ -2.44
SCM3
Q12334
SBH2
YER019C-A
267 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
SCM3
Q12334
tM(CAU)Q2
tM(CAU)Q2
78 nt
-0.19
□□□□□ -2.44
SCM3
Q12334
TFB5
YDR079C-A
219 nt
-0.21
□□□□□ -2.44
SCM3
Q12334
YOR170W
YOR170W
306 nt
-0.23
□□□□□ -2.45
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